Un LIMS cloud su misura costruito per assorbire i volumi del testing pandemico
Un LIMS cloud su misura valida ogni scansione di campione genetico in 250ms, ha ridotto il tasso di errore di scansione allo 0,5% e ha fatto risparmiare 70 secondi di reportistica manuale per campione — dimostrato su oltre 6M di campioni mentre Oncologica scalava da centinaia a decine di migliaia di test PCR al mese.
La sfida
- Il COVID-19 ha fatto passare i test PCR di Oncologica da poche centinaia a decine di migliaia di campioni al mese, e l'infrastruttura del laboratorio non riusciva a starci dietro.
- La reportistica manuale era lenta, dispendiosa in termini di lavoro e soggetta a errori — insostenibile ai nuovi volumi.
- Una mole enorme di dati sanitari sensibili doveva essere gestita in sicurezza e mantenuta conforme a standard rigorosi.
Cosa abbiamo fatto
- Abbiamo costruito un LIMS cloud che valida in tempo reale le scansioni dei campioni genetici, sostituendo la reportistica manuale diventata il collo di bottiglia.
- Il sistema gira come microservizi su Google App Engine, così la sicurezza dell'infrastruttura resta al provider e il team può concentrarsi sull'applicazione.
- Un'architettura headless basata su REST API separa il motore principale dal front end, permettendo ad app mobile e sistemi di terze parti di raggiungere le funzioni core in sicurezza.
- L'interfaccia è stata costruita in Vue.js, e la piattaforma rispetta HIPAA, ISO/IEC 27001 e HITRUST CSF con crittografia AES-256 e trasferimenti protetti via SSL.
Risultati
- 6M+campioni validati in produzione
- 0.5%tasso di errore di scansione
- 250msper validare un campione
- 70srisparmiati per campione nella reportistica manuale
“La piattaforma ha assorbito un volume che non avremmo mai potuto gestire su carta, e lo ha fatto senza far salire i tassi di errore.”
Head of Laboratory, Oncologica
Il contesto
Oncologica è uno dei cinque principali laboratori diagnostici del Regno Unito, con test PCR e sequenziamento COVID per il pubblico e per gli ospedali del NHS. Un team di circa 650 persone copre scienza di laboratorio, operazioni e supporto.
Quando è arrivato il COVID-19, la domanda di test non è cresciuta gradualmente. È passata da poche centinaia di campioni al mese a decine di migliaia. La reportistica manuale del laboratorio era lenta, dispendiosa e soggetta a errori, e non era mai stata pensata per quel volume. Oltre al problema di throughput, una grande mole di dati sanitari sensibili doveva essere gestita in sicurezza e mantenuta conforme.
Cosa abbiamo costruito
Il cuore del lavoro è stato un Laboratory Information Management System cloud che valida in tempo reale ogni scansione di campione genetico, sostituendo la reportistica manuale diventata il collo di bottiglia.
- Microservizi su Google App Engine, così la sicurezza dell'infrastruttura resta al provider e il team può concentrarsi sull'applicazione.
- Un'architettura headless basata su REST API che separa il motore principale dal front end, permettendo ad app mobile e sistemi di terze parti di raggiungere le funzioni core in sicurezza.
- Un'interfaccia Vue.js per gli operatori di laboratorio, per gestire validazione e reportistica.
- Conformità a HIPAA, ISO/IEC 27001 e HITRUST CSF, con crittografia AES-256 e trasferimenti protetti via SSL.
Come funziona in produzione
Arriva una scansione, il sistema valida le informazioni del campione contro il record, e il risultato viene riportato senza che nessuno debba ridigitarlo. Ciò che prima era controllo e reportistica manuale ora avviene in una frazione di secondo, e lo stesso percorso gestisce sia una manciata di campioni sia un intero batch senza cambiare.
Il risultato
Il sistema è stato dimostrato su oltre sei milioni di campioni. Il tasso di errore di scansione si è assestato allo 0,5%, la validazione avviene in 250ms, e si risparmiano circa 70 secondi di reportistica manuale per campione, che si traducono in circa 1,8 ore per batch di test. Un calcolo KPI interattivo alimenta un piano di miglioramento continuo, così il laboratorio continua ad affinare il processo invece di rincorrere le emergenze.
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